為使消毒工作順利進行，取得較好效果，須根據不同情況，選擇適當方法。
一般應考慮以上幾個問題。病原體的種類不同傳染病病原體各有特點，對不同消毒方法的耐受性不同。如細菌芽胞對各種消毒措施的耐受力最強，必須用殺菌力強的滅菌劑、熱力或輻射處理，才能取得較好效果。故一般將其作為最難消毒的代表。其他如結核杆菌對熱力消毒敏感，而對一般消毒劑的耐受力卻比其他細菌為強。真菌孢子對紫外線抵抗力很強，但較易被電離輻射所殺滅。腸道病毒對過氧乙酸的耐受力與細菌繁殖體相近，但季胺鹽類對之無效。肉毒杆菌素易為堿破壞，但對酸耐受力強。至於其他細菌繁殖體和病毒、螺旋體、支原體、衣原體、立克次體對一般消毒處理耐受力均差。
帶AQ可以真正省心省力起來。第一，它是真正多功能滅菌配方選擇，滅菌效果達到99.99%，容易攜帶，可以製造無菌空間。第二，多面使用，可以直接將其噴在空氣中或者是噴在物品上面，可以直接噴於皮膚表面，有全面殺菌的好效果，維持效果達到2~4個小時。常見消毒方法一般均能取得較好效果。消毒對象的性質同樣消毒方法對不同性質物品、效果往往不同。對油漆光滑的牆面，噴灑藥液不易停留，應以沖洗、擦拭為宜。對較粗糙牆面，易使藥液停留，可用噴灑消毒。環氧乙烷熏蒸，對易於吸收藥物的布、紙張效果較好，而對金屬表面，須延長時間。糞便、痰液消毒不宜用凝固蛋白質藥消毒櫃物處理，因蛋白質凝固對病原體可起保護作用，高壓蒸氣殺菌效果雖好，但不宜用於毛皮，塑料和人造纖維制品。
環氧乙烷熏蒸賽璐珞制品，高濃度過氧乙酸或含氯消毒劑如漂白粉浸泡綿織品，來蘇液多次長時間浸泡乳膠手套，均可造成損壞。對於食品及餐具不宜用有毒或有惡臭的消毒液處理。
